定性分析では、未知のスペクトルはライブラリ内の既知のスペクトルと比較されます。各ガスは、スペクトルによって「明確に決定」されます。ライブラリデータとの比較は、単純なパターン認識プロセスです。利用可能かどうかによっては、いくつかの補助ツールのいずれかを使用して比較を行うことができます。たとえば、5つまたは10の最高峰の位置、サイズ、および順序に従います。通常、スペクトルが標準化された後で、最高線の高さを100または1000に設定して比較することができます(例として表4.5を参照)。
比較は、表のコレクション(A.コルニュ&R.マソット:質量スペクトルデータの編集など)に基づいて手動で行うことも、コンピュータ支援を受けて行うこともできます。大規模なデータベース(質量スペクトルデータベース、英国王立化学協会、ケンブリッジ大学など)を使用することもできます。
ライブラリ情報と比較する場合は、同一のイオン源を使用したか、少なくとも同一の電子衝突エネルギーを使用したかに注意する必要があります。
しかし、これらの機能はすべて、真空技術で発生する問題のために、一般的に複雑すぎます。多くの市販の質量分析計では、画面に多数のライブラリスペクトルを表示できるため、ユーザーは、「ライブラリ物質」が測定された物質に含まれている可能性があるかどうかをすぐに確認できます。通常、測定されたスペクトルは、ガスの混合の結果であり、測定されたスペクトルから個々の(または複数の)ガスのスペクトルを(試行的に)差し引く機能が画面にあると特に便利です。差し引きで主要ピークに負の値が出ないときのみ、ガスが存在する可能性があります。図4.16は、Transpector-Wareソフトウェアを使用した段階的な減算手順を示します。
定性分析の準備方法に関係なく、結果は、常に「提案」(混合物に含まれる可能性があるガスの仮定)に過ぎません。この提案は、特定の物質がスペクトルに含まれる可能性を考慮するなどして、まだ検討する必要があります。また、この物質の新しいスペクトルを記録すると、より明確にすることができます。